320px|right right|350px Hromosom 16 je jedan od 23 para hromosoma čovjeka. Ljudi normalno imaju njegove dvije kopije. Sadrži oko 90 miliona baznih parova (gradivnog materijala DNK) , a uključuje nešto ispod 3% ukupne količine DNK u ćeliji.
Identificiranje gena na svakom hromosomu je veoma aktivno područje genetičkih istraživanja. Budući da u tom smislu postoje različiti pristupi, estimirani podaci često variraju. Hromosom 16 vjerovatno sadrži 850 – 1.200 gena.
Geni Broj gena Slijede neke od procjena broja gena za ljudski hromozom 16. Budući da istraživači koriste različite pristupe označavanjaja genoma, njihova predviđanja broja gena na svakom hromosomu variraju (za tehničke detalje pogledajte predviđanje gena). Među različitim projektima, zajednički projekat konsenzusnog kodiranja (Konsenzusni CCDS) zauzima izuzetno konzervativnu strategiju. Dakle, CCDS-ovo predviđanje broja gena predstavlja donju granicu ukupnog broja gena koji kodiraju ljudske proteine.
Baza podataka Protein-kodirajući geni Geni nekodirajuće RNK Pseudogeni Izvor Datum objave CCDS 795 — — 2016-09-08 HGNC 802 251 365 2017-05-12 Ensembl 865 1,046 462 2017-03-29 UniProt 838 — — 2018-02-28 NCBI 912 652 502 2017-05-19
Lista gena
Slijedi djelimična lista gena na ljudskom hromosomu 16. Potpunu listu potražite u linku u informacijskom okviru s desne strane.
ACSF3: Kodira enzim, član 3 porodice acil-CoA sintetaza ACSM2B: Kodira enzim mitohondrijaka acil-koenzim A sintetaza ACSM2B ACSM3: Kodira enzim mitohondrijska 2 acil-koenzim A sinthetaza ACSM3 ADHD1: Kodira protein 1 osjetljivosti na poremećaj deficita pažnje i hiperaktivnosti ARL6IP1: Kodira faktoroliki 6-interaktivni protein 1 ADP-ribozilacije ARMC5: BMIQ5: Kodira kvantitativno obilježje lokusa 5 za BMI C16orf58: Kodira protein otvorenog okvira čitanja 58 hromosoma 16 C16orf71: Kodira neokarakterizirani protein otvorenog okvira čitanja 71 hromosoma 16 C16orf84: C16orf95: C16orf96: Kodira protein C16orf96, otvorenog okvira čitanja 96 hromosoma 16, CARHSP1: Kodira protein 1 kalcij-regulirane toplotne stabilnosti CASP16P: Kodira protein kaspazni 16, pseudogen CCDC113: Kodira protein 113 upredenog domena Ccdc78: Kodira protein sa domenom upredene zavojnice 78 (CCDC78) CDIPT: Kodira enzim CDP-diacilglicerol-inozitol 3-fosfatidiltransferaza CFDP1: Kodira protein 1 kraniofacijskog razvoja CHDS1: Kodira protein 1 osjetljivosti na koronarnu srčanu bolest CIAPIN1: Kodira anamorzin (originalno, citokinski inducirana inhibitor 1 apoptoze) CKLF: Kodira hemokinoliki faktor CLUAP1: CMTM2: Kodira protein CKLF-oliki MARVEL koji sadrži protein 2 transmembranskog domena CCDC135: Kodira protein 135, koji sadrži domen upredene zavojnice COTL1: Kodira koatozinoliki protein CTRL: Kodira enzim himotripsinolika proteaza DCTPP1: Kodira enzim dCTP pirofosfataza 1 DEL16p13.3, RSTSS: Kodira sindrom delecije 16p13.3 (Rubinstein-Taybijev sindrom) DHX38: Kodira enzim DEAH-boksna helikaza 38 DUP16p13.3, C16DUPq13.3: Kodira sindrom duplikscije 16p13.3 EMP2: Kodira protein 2 epitelne membrane ENKD1: Kodira protein 1 koji sadrži enkurinski domen ERAF: Kodira stabilizirajući protein alfa-hemoglobina FAHD1: Kodira protein 1 koji sadrži fumarilacetoacetatni domen hidrolaze FAM57B: Kodira proteinski člsn 8 porodice sa sličnošću sekvence 57 FBRS: Kodira vjerovatni dugi transkript proteina fibrozin-1 FOXC2-AS1: Kodira protein FOXC2 antisens RNK 1 GLG1: Kodira protein 1 Golgijevog aparata HBAP1: Kodira hemoglobinski alfa pseudogen 1 HBHR, ATR1: Kodira protein sindroma alfa-talasemija/mentalna retardacija tip 1 HIRIP3: Kodira HIRA-interaktivni protein 3 HCL2: (znan i kao RHA or RHC): Kodira proteine vezane za crvenu kosu HN1L: Kodira protein hematološki i neurološki eksprimirani sličan proteinu 1 IBD8: Kodira protein upalne bolesti crijeva 8 IHPS2: Kodira infantilnu hipertrofiranu pilornu stenozu 2 ITFG3: Kodira protein ITFG3 KDM8: Kodira protein lizinska demetilaza 8 LINC00273: Kodira protein uuge intergenske neproteinsko kodirajuće RNK 273 LOC124220: Kodira protein zimogenih granula 16 homolog B LOC81691: LUC7L: Kodira protein pretpostavljenog vezanja RNK-protein Luc7-oliki 1 LYPLA3: Kodira enzimsku grupu XV fosfolipaza A2 MC1R: Kodira melanokortinski receptor 1 MCOPCT1: Kodira mikroftalmiju sa kataraktom 1 METRN: Kodira protein meteorin, regulator diferencijacije ćelija glije METTL26/JFP2: Kodira protein otvorenog okvira čitanja 13 hromosoma 16, MKL2: Kodira protein MKL/miokardin-oliki 2 MLYCD: MPHOSPH6: Kodira enzim M-faze fosfoproteina 6 MT1G: Kodira protein metalotionein-1G MT1X: Kodira protein metalotionein 1X NIP30: Kodira protein NIP30 NOB1: Kodira RNK-vezujući protein NOB1 NOMO1: Kodira protein čvornog modulatora 1 NPW: Kodira protein neuropeptid W NUBP2: Kodira nukleotidno vezani protein 2 NUPR1: Kodira jedarni protein 1 OGFOD1: PDF: Kodira mitohondrijski enzim peptid-deformilaza, PDPR: Kodira protein piruvat dehidrogenaza, regulacijska podjedinica fosfataza PKDTS: Kodira protein policistne bubrežne diseaze, teške infantile , sa tuberoznom sklerozom PMFBP1: Kodira protein vezanog za poliamin-modulirani faktor 1- POLR3K: Kodira enzim DNK-usmjerene RNK-polimersze III, podjedinica RPC10 PRR35: Kodira prolinom bogati protein 35 RPS15A: Kodira ribosomni 40S protein S15a RSL1D1: Kodira ribosomni L1 domen-sadržavajući protein 1 SHCBP1: Kodira SHC SH2 domen-vezujući protein 1 SLZ1: Kodira protein SLX1 strukturno-specifičnih endonukleaza, podjedinica homologa B (S. cerevisiae) SNAI3-AS1: Kodira protein SNAI3 antisens RNK 1 SNORD71: Kodira protein male jedarne RNK, C/D-boks 71 SPSB3: Kodira protein SplA/rijanodinskog receptorskog domena i SOCS-boks sadržavajući protein 3 SRCAP: Kodira enzim helikaza SRCAP TANGO6: Kodira transportniprotein proteinski homolog 6 organizaacije Golgijevog aparata TAO2: Kodira serin/treoninski protein kinaza TAO2 TBC1D24: Kodira protein porodice TBC1 domena, član 24 TELO2: Kodira protein regulacije dužine telomera, TEL2 homolog TMEM112: Kodira enzim faktor 1 sazrijevanja lipaza TMEM8A: Kodira protein, transmembranski protein 8A TNRC6A: Kodira protein trinukleotidno ponavljanje-sadržavajućeg gena 6A Supresori tumora složene tuberozne skleroze: Kodira protein FALSE TSR3: UNKL: Kodira protein nesređenog RING prsta VAT1L: Kodira protein 1 transporta vezikulskih homologa amina (sličnih T. californica) VPS35L: Kodira endosomni protein VPS35 koji liči na faktor sortiranja ZG16: ZNF23: Kodira protein cinkovog prsta 23 ZNF200: Kodira protein cinkovog prsta 200 ZNF263: Kodira protein cinkovog prsta 263 ZNF629: Kodira protein cinkovog prsta 629
Bolesti i poremećaji Aspergerov sindrom Autosomno dominantna bolest policistnih bubrega(PKD-1) Battenova bolest Kombinovana malonska i metilmalonska acidurija (CMAMMA) Poremećaj hiperaktivnosti i deficita pažnje (ADHD) Poremećaji iz spektra autizma Porodična mediteranska groznica (FMF) Sinestezija Talasemija Trisomija 16 Morquioov sindrom
Pridružena svojstva Crvena kosa
Citogenetičke pruge
+ G-pruganje ljudskog hromosoma 16 u rezoluciji 850 bphsGenome Decoration Page, NCBI. Ideogram data for Homo sapience (850 bphs, Assembly GRCh38.p3). Last update 2014-06-03. Retrieved 2017-04-26.
+ G-pruge ljudskog hromosoma 16 u rezoluciji 850 bphsGenom Decoration Page, NCBI. Ideogram data for Homo sapience (850 bphs, Assembly GRCh38.p3). Last update 2014-06-03. Retrieved 2017-04-26.HromosomKrak Pruga/bend ISCNstartThese values (ISCN start/stop) are based on the length of bands/ideograms from the ISCN book, An International System for Human Cytogenetic Nomenclature (2013). Arbitrary unit. ISCNstopBazni parstart Bazni parstop BojaGustoća 16 p 13.3 0 352 gneg 16 p 13.2 352 596 gpos 50 16 p 13.13 596 813 gneg 16 p 13.12 813 948 gpos 50 16 p 13.11 948 1070 gneg 16 p 12.3 1070 1246 gpos 50 16 p 12.2 1246 1409 gneg 16 p 12.1 1409 1558 gpos 50 16 p 11.2 1558 1856 gneg 16 p 11.1 1856 2045 acen 16 q 11.1 2045 2194 acen 16 q 11.2 2194 2709 gvar 16 q 12.1 2709 2953 gneg 16 q 12.2 2953 3142 gpos 50 16 q 13 3142 3346 gneg 16 q 21 3346 3657 gpos 100 16 q 22.1 3657 4023 gneg 16 q 22.2 4023 4118 gpos 50 16 q 22.3 4118 4294 gneg 16 q 23.1 4294 4551 gpos 75 16 q 23.2 4551 4659 gneg 16 q 23.3 4659 4768 gpos 50 16 q 24.1 4768 4930 gneg 16 q 24.2 4930 5025 gpos 25 16 q 24.3 5025 5120 gneg Napomene: Za nomenklaturu citogenetskih traka, pogledajte članak lokus. Vrijednosti (ISCN start/stop) temelje se na dužini opsega/ideograma iz knjige ISCN, Međunarodni sistem za lljudsku citogenetičku nomenklaturu (2013). gpos – Regija koja je pozitivno obojena G pruganjem, općenito AT-bogata i siromašna genima; gneg – Regija koja je negativno obojena, općenito CG-bogata i bogata genima; acen – Centromere. var – Varijabilna regija; stalk – drška
Reference
Dodatna literatura
In http://omim.org/search?index=geneMap&search=16p13.3
Vanjski linkovi
Kategorija:Hromosomi * Kategorija:Citogenetika