Metropolita odmówił nadania kanonicznej klauzuli dokonanym nowym święceniom, sam zaś arcybiskup Leoncjusz otrzymał 30 listopada 1962 r., reprymendę ze strony Arcybiskupiego Soboru Rosyjskiego Kościoła Prawosławnego poza granicami Rosji. W obronie arcybiskupa Leoncjusza ujęli się arcybiskupi Awerkiusz (Taszew) oraz św. Jan (Maksymowicz). Latem 1971 roku archimandryta Chryzostom (Kiuzis) został podniesiony do godności metropolity. W konsekracji wzięli udział zwierzchnik Synodu Cerkwi arcybiskup Ateński i całej Hellady Auksetniusz (Patras), metropolita Pireusu Geroncjusz (Mariolis), oraz biskupi z Rosyjskiego Kościoła Prawosławnego poza granicami Rosji.
Struktura wewnętrzna Na czele Cerkwi stoi Arcybiskup Aten i całej Hellady Kallinik. Kościół roztacza rozległą jurysdykcję nad misjami Kościoła za granicą;