W sieciach chronionych zaporą sieciową komunikacja z serwerami FTP wymaga zwolnienia odpowiednich portów na tej zaporze lub routerze. Możliwe jest zainstalowanie wielu serwerów FTP na jednym routerze. Warunkiem jest rozdzielenie portów przez router dla każdego serwera.
Serwer FTP, zależnie od konfiguracji, może pozwalać na anonimowy, czyli bez podawania hasła uwierzytelniającego, dostęp do jego zasobów. Najczęściej jednak serwer FTP autoryzuje każde połączenie za pomocą loginu i hasła.
Obsługa w przeglądarkach W chwili połączenia z adresem FTP zamiast HTTP zawartość dostępna na serwerze zdalnym jest przedstawiana w sposób zbliżony do innych elementów sieci Web. W przeglądarce Firefox można uruchomić pełnoprawnego klienta FTP po zainstalowaniu rozszerzenia FireFTP.
Wraz z wydaniem Google Chrome w wersji 88 przeglądarka utraciła całkowicie obsługę protokołu. W 2019 roku Mozilla analizowała możliwe opcje, włączając w to usunięcie jedynie wsparcia dla już nieużywanych implementacji FTP celem uproszczenia kodu programu. W kwietniu 2021 roku Mozilla wydała Firefoksa 88.0, który domyślnie miał wyłączoną obsługę FTP.