Został odwołany z funkcji ministra 6 października 2020. Następnego dnia objął stanowisko sekretarza stanu w Ministerstwie Sprawiedliwości (odpowiedzialnego za administrację sądową, budżet i Służbę Więzienną). W wyborach w 2023 z powodzeniem ubiegał się o poselską reelekcję, uzyskując 39 902 głosy (co stanowiło najlepszy indywidualny wynik w okręgu). W grudniu tego samego roku zakończył pełnienie funkcji wiceministra. 12 października 2024, po wejściu Suwerennej Polski w skład PiS, zasiadł w komitecie politycznym tej partii. W listopadzie tego samego roku objął funkcję prezesa zarządu okręgowego tej partii w Rybniku.
Postępowania karne Afera Pegasusa 28 czerwca 2024, w związku z aferą Pegasusa, Sejm wyraził zgodę na pociągnięcie go do odpowiedzialności karnejUchwała Sejmu Rzeczypospolitej Polskiej z dnia 28 czerwca 2024 r. w sprawie wyrażenia przez Sejm Rzeczypospolitej Polskiej zgody na pociągnięcie do odpowiedzialności karnej posła Michała Piotra Wosia ()..
27 sierpnia 2024 Prokurator Krajowy przedstawił Michałowi Wosiowi zarzut przekroczenia uprawnień i niedopełnienia obowiązków, polegających na przekazaniu 25 mln zł ze środków Funduszu Sprawiedliwości na zakup oprogramowania Pegasus dla CBA;