Pierwsze swoje przedstawicielstwo w Krakowie ZSRR utrzymywał, w randze konsulatu generalnego, w latach 1939–1941Andrzej L. Sowa: Kraków pod okupacją hitlerowską – stan badań, [w:] Kraków w czasie II wojny światowej. Materiały z sesji Towarzystwa Miłośników Historii i Zabytków Krakowa, 1992..
W maju 2025 roku Minister Spraw Zagranicznych Rzeczypospolitej Polskiej, Radosław Sikorski, poinformował o cofnięciu zgody na działalność konsulatu. Decyzja ta była reakcją na potwierdzenie udziału rosyjskich służb specjalnych w podpalenie hali targowej przy ul. Marywilskiej w Warszawie. Konsulat oficjalnie zakończył działalność pod koniec czerwca 2025 rokuOgłoszenie w związku z zamknięciem Konsulatu Generalnego Federacji Rosyjskiej w Krakowie.
Siedziba Po II wojnie światowej konsulat pomieszczono w mieszkaniu w kamienicy z 1934 (proj. Alfred Düntuch i Stefan Landsberger) przy ul. Lenartowicza 18/7 (1945-1946)Gminna ewidencja zabytków – KRAKÓW., następnie w wilii art déco z 1924 (proj. Jerzy Struszkiewicz) przy ul. Sienkiewicza 27 (1946)Mirosław Golon: Radzieckie służby dyplomatyczne i konsularne w Polsce w latach 1944–1961, [w:] Czasy Nowożytne, Tom XX, Rok 2007., obecnie Hotel „Grottger”, w kamienicy z końca lat 30., po 1935?, przy ul. Szopena 1 (1946-)Mariusz Rzeszutko: Konsulaty w Krakowie.