W 1984 po fuzji z Pro Trapani klub zmienił nazwę na Associazione Sportiva Trapani 1906. W 1985 klub wrócił do Serie C2, a w 1990 spadł do Campionato Interregionale. Z powodów finansowych klub został rozwiązany.
W 1990 powstał nowy klub Trapani Calcio S.p.A., który wykupił miejsce sportowe poprzednika i startował w Campionato Interregionale. W 1993 klub awansował do Serie C2, a w 1994 do Serie C1. W 1997 został zdegradowany do Serie C2, a w 2000 do Serie D. Ze względu na trudną sytuację finansową klubu, zrezygnował z występów w Serie D i był zmuszony rozpocząć sezon 2000/01 w Eccellenza Sicilia (6 poziom). W sezonie 2001/02 klub wycofuje się z mistrzostw po 22.kolejce w grupie A Eccellenza Sicilia, po czym został rozwiązany.
Latem 2002 inny klub Associazione Sportiva Città di Trapani, który zajął 4.miejsce w grupie A Eccellenza Sicilia, zmienił nazwę na Associazione Sportiva Trapani, a dzięki dobrej klasyfikacji w lidze, został zakwalifikowany do Serie D. W 2006 klub jednak spadł do Eccellenza. W sezonie 2007/08 zajął drugie miejsce w grupie A i po zwycięstwie w barażach wrócił do Serie D. W sezonie 2009/10 po zajęciu drugiego miejsca w grupie I przegrał w półfinale play-off z US Avellino 1912, ale został zakwalifikowany do Lega Pro Seconda Divisione. W 2010 został przemianowany na Trapani Calcio S.r.l.