Na III roku studiów założył pierwszą firmę, która zajmowała się składaniem komputerów oraz projektowaniem stron WWW. W 1999 roku stworzył firmę Integer.pl, która początkowo zajmowała się dystrybucją ulotek w Krakowie, a potem działalnością na rynku pocztowym. W 2006 założył przedsiębiorstwo InPost. W 2009 roku rozpoczął budowę sieci urządzeń Paczkomat® w Polsce.
W 2011 zadebiutował na liście najbogatszych PolakówUrodził się w Nędzy – został milionerem – wprost.pl.. W 2021 zajął siódme miejsce na liście najbogatszych Polaków magazynu „Forbes”, z majątkiem wycenianym na 5,7 mld zł.
Spółka Rafała Brzoski, Rio Amsterdam, przejęła większościowe udziały w Bakalland. Po fuzji z Purella Superfoods w 2022 roku firma przyjęła nową nazwę – FoodWell. Brzoska i Marian Owerko posiadają w niej pakiet większościowy.
Brzoska jest też współzałożycielem funduszy bValue VC i Inovo VC. Za ich pośrednictwem zainwestował m.in. w: SALESmanago, Tidio, RESPONSIBLE oraz Your KAYA, a także takie firmy jak Party Deco.
Jest również znaczącym akcjonariuszem spółki CCC.