To właśnie w barwach tego klubu zdobył pierwszą bramkę na zawodowych boiskach podczas wygranego 3:1 meczu z Gimnàstikiem Tarragona, zaś sezon 2017/18 zakończył w sumie z 18 występami, ale nie uchronił Elche od degradacji. 30 kwietnia 2018 Fabián ustalił wynik spotkania z Málagą na 2:1, zapewniając tym samym Betisowi awans do Ligi Europy UEFA.
5 lipca 2018 Fabián zdecydował się opuścić ojczyznę i podpisał pięcioletni kontrakt z włoskim SSC Napoli.
Statystyki kariery (aktualne na dzień 30 sierpnia 2022) KlubSezonLigaLigaPuchar krajuEuropaSumaMeczeBramkiMeczeBramkiMeczeBramkiMeczeBramkiReal Betis2014/15Segunda División6000–602015/16Primera División12020–1402016/174010–50Elche CF (wyp.)2016/17Segunda División18100–181Real Betis2017/18Primera División34310–353SSC Napoli2018/19Serie A275211114072019/2033351804642020/2133310814242021/223271050387PSG2022/23Ligue 127330703732023/2421152903532024/2530470171545Ogólnie w karierze277 30 28 4 65 3 370 37
Sukcesy Real Betis Segunda División: 2014/2015
SSC Napoli Puchar Włoch: 2019/2020
Paris Saint-Germain Liga Mistrzów UEFA: 2024/2025, 2025/2026 Superpuchar UEFA: 2025 Puchar Interkontynentalny: 2025 Mistrzostwo Francji: 2022/2023, 2023/2024, 2024/2025 Puchar Francji: 2023/2024, 2024/2025 Superpuchar Francji: 2023, 2024, 2025