Zawodowo związany z SGGW w Warszawie. Pełnił na tej uczelni funkcje prodziekana oraz dziekana Wydziału Ogrodnictwa i Architektury Krajobrazu oraz kierownika Międzywydziałowego Studium Biotechnologii. Był również wiceprzewodniczącym Polskiego Towarzystwa Genetycznego, przewodniczącym Komitetu Biotechnologii PAN oraz rady naukowej Instytutu Genetyki Roślin PAN. Powoływany w skład rad nadzorczych czasopism naukowych „Journal of Applied Genetics” i „International Journal of Horticultural Science”. Od 2004 członek korespondent, a od 2016 członek rzeczywisty Polskiej Akademii Nauk, w latach 2015-2017 wybrany na wiceprezesa tej instytucjiStefan Malepszy na stronie pan.pl (dostęp 13.10.2024).
Prof. Stefan Malepszy opublikował 136 prac naukowych (66 z IF), 29 monografii i rozdziałów w podręcznikach. Był kierownikiem lub głównym wykonawcą 18 grantów. Stworzył “szkołę naukową” – wypromował 25 doktorów, z tego 11 osób otrzymało stopień doktora habilitowanego lub tytuł profesora. Był opiekunem wielu prac inżynierskich oraz magisterskich. Prowadził bardzo intensywną działalność dydaktyczną na kierunkach studiów realizowanych na Wydziale Ogrodniczym SGGW.
Wybrane publikacje