Po wybuchu II wojny światowej w czasie kampanii wrześniowej 1939 nadal pełnił służbę w Komendzie Obwodu w Sanoku. Po agresji ZSRR na Polskę z 17 września 1939 został aresztowany przez Sowietów, a następnie był przetrzymywany w obozie w Ostaszkowie. Na wiosnę 1940 został wywieziony i zamordowany w siedzibie Obwodowego Zarządu NKWD w Kalininie (obecnie Twer) przez funkcjonariuszy oraz pracowników NKWD przybyłych z Moskwy na mocy decyzji Biura Politycznego KC WKP(b) z 5 marca 1940. Jest pochowany na terenie obecnego Polskiego Cmentarza Wojennego w Miednoje.
W 1947 przed Sądem Grodzkim w Sanoku, na wniosek Romualdy Sochowej, zamieszkałej przy ul. Wolności 12 w Jeleniej Górze, toczyło się postępowanie o uznanie za zmarłego Stanisława Sochę.
Ordery i odznaczenia
Srebrny Krzyż Zasługi (10 listopada 1928)M.P. z 1928 r. nr 260, poz. 636 „w uznaniu zasług, położonych w poszczególnych działach pracy dla wojska”.