Młodość Bonifacy i jego starszy brat Amadeusz IV hrabia Sabaudii byli synami Tomasza I, hrabiego Sabaudii i Małgorzaty Genewskiej. Urodził się w roku 1206 lub 1207 w Château de Sainte-Hélène du Lac (Sabaudia). Był jedenastym dzieckiem swoich rodziców. Niektóre źródła podają, że w młodym wieku wstąpił do zakonu kartuzów. Nie ma jednak na to żadnych dowodów i byłoby to bardzo nietypowe dla szlachcica, żeby wstąpić do zakonu z tak surową regułą. Spośród jego braci Piotr został mianowany hrabią Richmond w 1240 roku, a Wilhelm był biskupem Valence i kandydatem na biskupa Winchester w Anglii.
Kariera kościelna lewo|mały|250x250px|Lądowanie Henryka III króla Anglii w Akwitanii. Bonifacy był jego wujem poprzez małżeństwo Od 1323 roku Bonifacy był przeorem w Nantui oraz biskupem diecezji Belley w Burgundii. Kiedy zmarł jego ojciec otrzymał zamek Ugine jako swoje dziedzictwo, po czym w 1238 roku zrezygnował z wszelkich praw do pozostałego spadku. W 1234 roku jego siostrzenica Małgorzata Prowansalska wyszła za mąż za króla Francji, Ludwika IX. Po ślubie swojej kolejnej siostrzenicy, Eleonory Prowansalskiej z Henrykiem III, władcą Anglii, ten ostatni próbował doprowadzić do wyboru Wilhelma, brata Bonifacego, na biskupa Winchester, ale nie uzyskał na to zgody kapituły katedralnej.