Pierwszym ważnym przedsięwzięciem Ośrodka Badań nad Totalitaryzmami im. Witolda Pileckiego jest program Zapisy terroru. Świadectwa przed Główną Komisją Badania Zbrodni Niemieckich/Komisją Ścigania Zbrodni przeciwko Narodowi Polskiemu. Program ten inicjuje utworzenie cyfrowego polsko-angielskiego repozytorium dokumentów historycznych dotyczących zbrodni nazistowskich i komunistycznych.
W sierpniu 2016 Ośrodek uruchomił portal internetowy „Zapisy Terroru”, w którym udostępniane są świadectwa ludności cywilnej okupowanej Europy.
Patron Patronem Ośrodka Badań nad Totalitaryzmami jest rotmistrz Witold Pilecki, bohater polskiego podziemia, awansowany pośmiertnie do stopnia pułkownika. Symbol solidarności z ofiarami i tragicznej walki jednostki z dwoma totalitaryzmami: nazistowskim i komunistycznym.
Wybrane publikacje II wojna światowa: historia, która nie chce przeminąć. Dyskusje o polskim doświadczeniu w wieku XX i polityce pamięci, redaktor prowadzący Leszek Zaborowski, Warszawa: Ośrodek Badań nad Totalitaryzmami im. Witolda Pileckiego 2017, . Zapisy terroru – Warszawa, koncepcja Anna Gutkowska, Tomasz Stefanek, redaktor prowadzący Leszek Zaborowski, wprowadzenia do rozdziałów Michał Karpowicz, Leszek Zaborowski, Warszawa: Ośrodek Badań nad Totalitaryzmami im.