Wiosną 2015 Quiñones przeszedł do ówczesnego mistrza Kolumbii – drużyny Independiente Santa Fe ze stołecznej Bogoty. Początkowo był głównie rezerwowym w taktyce trenera Gustavo Costasa, sprawiał również problemy dyscyplinarne (przez tydzień nie pojawiał się na treningach ekipy), lecz w późniejszym czasie zaczął notować udane występy i przekonał do siebie kibiców. Jeszcze w tym samym roku dotarł z Santa Fe do finału krajowego pucharu, zdobył superpuchar Kolumbii – Superliga Colombiana, a także triumfował z ekipą prowadzoną przez Gerardo Pelusso w kontynentalnych rozgrywkach Copa Sudamericana. Sam nie wziął jednak udziału w decydujących meczach, gdyż w listopadzie 2015 władze klubu zdecydowały się dyscyplinarnie rozwiązać z nim kontrakt (zawodnik został przyłapany na zgrupowaniu drużyny pod silnym wpływem alkoholu).
W styczniu 2016 Quiñones wyjechał do Meksyku, podpisując umowę z tamtejszą ekipą Pumas UNAM ze stołecznego miasta Meksyk.