Po agresji ZSRR na Polskę w nieznanych okolicznościach dostał się do niewoli sowieckiej. Przebywał w obozie jenieckim NKWD w Kozielsku. Między 11 a 12 kwietnia 1940 roku przekazany do dyspozycji naczelnika smoleńskiego obwodu NKWD – lista wywózkowa 022/1 z 9 kwietnia 1940 roku. Został zamordowany między 13 a 14 kwietnia 1940 roku przez funkcjonariuszy NKWD w lesie katyńskim. Zamordowanych w tym miejscu jeńców grzebano w bezimiennych mogiłach zbiorowych, gdzie od 28 lipca 2000 roku mieści się oficjalnie Polski Cmentarz Wojenny w Katyniu. Odnalezione szczątki podczas ekshumacji prowadzonej przez Niemców w 1943 roku, zapis w dzienniku ekshumacji pod datą 8 maja 1943 roku i nr 1459, należałoby przypisać Franciszkowi Adamskiemu. Przy szczątkach znaleziono list adresowany: Adam Franciszek, Kozielsk, zaświadczenie szczepień obozowych nr 1651, medalik z łańcuszkiem. Zapis na liście AM-206-1459 i liście Komisji Technicznej PCK pod numerem 01459.