thumb|Obrona cytadeli samarkandzkiej w 1868. Samarkanda po raz pierwszy została zdobyta przez Rosjan w 1865. thumb|Emirat Buchary pod rosyjskim protektoratem Rosyjski podbój Emiratu Buchary trwał z przerwami w latach 1842–1868.
Od początku XIX wieku pomiędzy Wielką Brytanią a Imperium Rosyjskim trwała Wielka Gra, czyli wyścig kolonialny o Azję Środkową. W centrum zainteresowania tych państw znalazły się szczególnie Chanat Chiwy, Afganistan, Chanat kokandzki, oraz Emirat Buchary. Łupieskie rajdy muzułmańskich mieszkańców Buchary i Chiwy zachęcały lokalnych gubernatorów Rosji do podjęcia inicjatywy podporządkowania sobie tych krajów. Dodatkowo wysłannicy rosyjscy, oraz brytyjscy byli traktowani w Bucharze lekceważąco i pogardliwie. W 1862 Rosja rozpoczęła wojnę z Emiratem Buchary, któremu początkowo udało się odeprzeć ataki, jednak został pokonany w maju 1866 roku. Emirat w wyniku konfliktu stracił większą część swojego terytorium. Następnie w 1867 car Aleksander II Romanow ustanowił nad Turkiestanem generalnego gubernatora w postaci Konstantina von Kaufmana. Stolicą rosyjskiego Turkiestanu jako nowej gubernii stał się Taszkent zdobyty w 1865. Wojna pomiędzy Rosją a Bucharą ponownie wybuchła w 1868, gdy emir Muzaffar ad-Din Bahadur Chan został zmuszony do przyjęcia statusu carskiego wasala.