Nagrody, wyróżnienia, odznaczenia Doktor honoris causa uczelni europejskich: Uniwersytetu Bolońskiego we Włoszech Uniwersytetu w Turku w Finlandii Berlińskiego Uniwersytetu Technicznego w Niemczech Åbo Akademi (Szwedzkiego Uniwersytetu z siedzibą w Turku w Finlandii) Politechniki Warszawskiej. Nagrody: “The Distinguished Achievements Award of the European Association for Theoretical Computer Science „w uznaniu wybitnego wkladu w rozwój informatyki teoretycznej”, przyznawana przez stowarzyszenie naukowe European Association for Theoretical Computer Science (2003), „Rozenberg Tulip Award”, przyznawana przez International Society for Nanoscale Science, Computation, and Engineering za wybitne osiągnięcia w dziedzinie obliczeń biomolekularnych i programowania molekularnego, nazwana została na cześć Grzegorza Rozenberga.
Publikacje Jest autorem sześciu monografii, redaktorem lub współredaktorem ponad 100 książek, autorem ponad 500 artykułów, z których prawie wszystkie zostały opublikowane w czołowych, prestiżowych czasopismach znajdujących się na liście filadelfijskiej. Jest również redaktorem lub współredaktorem ponad dwudziestu najbardziej liczących się czasopism z dziedziny informatyki teoretycznej oraz kilku serii książek wydawnictwa Springer.