Annemarie Huber-Hotz (ur. 16 sierpnia 1948 w Baar, zm. 1 sierpnia 2019 w Alpach Fryburskich) – szwajcarska urzędniczka państwowa, działaczka społeczna i polityk, kanclerz federalny w latach 2000–2007.
Życiorys Urodziła się 16 sierpnia 1948 w Baar, była córką kupca. Do szkoły średniej uczęszczała w rodzinnym mieście oraz w Ingenbohl.
Ukończyła studia z zakresu psychologii, socjologii, filozofii i etnologii na Uniwersytecie w Bernie oraz szwedzkim Uniwersytecie w Uppsali uzyskując licencjat w 1971. W latach 1973–1975 studiowała politologię w Graduate Institute of International and Development Studies w Genewie, zaś w latach 1976–1977 ukończyła studia podyplomowe z zakresu planowania przestrzennego na Politechnice Federalnej w Zurychu.
W latach 1973–1975 pracowała jako tłumaczka w Międzynarodowej Organizacji Pracy w Genewie, następnie w Biurze Planowania Przestrzennego rodzinnego kantonu Zug. Od 1978 pracowała w administracji federalnej. Do 1981 była pracownikiem Zgromadzenia Federalnego, następnie objęła kierownictwo nad sekretariatem Rady Kantonów, a od 1989 kierowała także działem naukowym Zgromadzenia Federalnego. W latach 1992–1999 była sekretarzem generalnym Zgromadzenia Federalnego.