W 1960 roku prowadzona przez Throckmortona ekspedycja odnalazła wrak statku u wybrzeży Turcji, który pochodził według szacunków z ok. 1300 p.n.e. Lokalizacja wraku została wskazana Throckmortonowi przez lokalnego poławiacza gąbki Kemala Arasa w 1958 roku. Throckmorton powrócił na miejsce rok później i oszacował czas konstrukcji znaleziska na okres późnego brązu. Następnie zorganizowano ekspedycję naukową, w której brali udział George Bass, Frederick Dumas i Joan du Plat Taylor – była to pierwsza ekspedycja archeologii podwodnej, podczas której zastosowano standardy naukowe archeologii lądowej.
W 1975 roku odkrył na dnie morza u zachodnich wybrzeży greckiej wyspy na Morzu Egejskim Dokos pozostałości ładunku antycznego statku, którego wiek szacowany jest na ok. 2200 rok p.n.e. Statek przewoził ponad 500 różnorodnych naczyń ceramicznych (m.in. dzbanów, amfor, mis, kubków czy naczyń typu askos), najprawdopodobniej z warsztatów w Argolidzie z przeznaczeniem dla mieszkańców okolicznych wysp.
Pisywał dla magazynu National Geographic, był