W 1990 został zatrudniony w WPiA UMK. Odbył aplikację sądową i radcowską, złożył egzamin sędziowski i radcowski. W 1996 został wpisany na listę radców prawnych. W latach 2005–2008 i 2008-2012 był prodziekanem do spraw studiów niestacjonarnych WPiA UMK. W 2006 objął stanowisko profesora nadzwyczajnego UMK. Od 2012 pełni na tej Uczelni funkcję dziekana Wydziału Prawa i Administracji, w którym jest też kierownikiem Katedry Prawa Cywilnego i Rodzinnego.
Oskarżenie o plagiat W grudniu 2011 ówczesne władze Wydziału Prawa i Administracji Uniwersytetu Mikołaja Kopernika w Toruniu zostały poinformowane o znamionach świadczących o prawdopodobieństwie dokonania plagiatu przez dra hab. Tomasza Justyńskiego w jego książce Prawo do kontaktów z dzieckiem w prawie polskim i obcym (Wolters Kluwer, Warszawa 2011). Zapożyczenia miały pochodzić z książki dr Nataschy Schulze pod tytułem Das Umgangsrecht. Die deutsche Reform im Kontext europäischer Rechtsentwicklung (Duncker Humblot, Berlin 2001). W lutym 2012, z polecenia rektora UMK wszczęto postępowanie wyjaśniające, w ramach którego zwrócono się o opinię prawną do Instytutu Prawa Ochrony Własności Intelektualnej UJ w Krakowie. Opinia ta jednoznacznie wskazała, że doszło do naruszenia praw autorskich.