Wody U podnóża stoku północno-wschodniego znajduje się dolny zbiornik wodny elektrowni szczytowo-pompowej Dlouhé Stráně o przybliżonych wymiarach poziomych (220 × 800) m i głębokości około 54 m o łącznej powierzchni około 14 ha (→ Zbiornik dolny).
Grzbiet główny (grzebień) góry Pradziad, biegnący od przełęczy Skřítek do przełęczy Červenohorské sedlo oraz dalej do przełęczy Ramzovskiej () jest częścią granicy Wielkiego Europejskiego Działu Wodnego, dzielącej zlewiska Morza Bałtyckiego i Morza Czarnego.
Góra Velká Jezerná położona jest na zachód od tej granicy, należy więc do zlewni Morza Czarnego, do którego płyną wody m.in. z dorzecza Dunaju, będącego przedłużeniem płynących z tej części Wysokiego Jesionika rzek i górskich potoków (m.in. rzeki Divoká Desná i płynących w pobliżu góry potoków: Zámecký potok, Merta czy Jezerná). Ze stoku północno-wschodniego płynie kilka krótkich, nienazwanych potoków wpływających do dolnego zbiornika wodnego elektrowni szczytowo-pompowej Dlouhé Stráně oraz będących dopływami rzeki Divoká Desná. Na przełęczy pomiędzy szczytami Velká i Malá Jezerná rozpościera się podmokłe torfowisko, z której płynie potok Jezerná oraz nieco mniejszy obszar torfowiskowy – na stoku północno-zachodnim, blisko połaci szczytowej na wysokościach około 1245 m n.p.m..