W 1948 premier Dżamil Mardam po raz czwarty powołał Sabriego al-Asaliego na stanowisko ministra spraw wewnętrznych. W tym charakter al-Asali był odpowiedzialny za utrzymanie porządku w kraju podczas gwałtownych protestów, jakie wybuchły po klęskach Syryjczyków w wojnie z Izraelem. Na jego polecenie aresztowanych zostało wielu liderów syryjskiej lewicy, szczególnie silnie występującej przeciwko rządowi i prezydentowi al-Kuwatliemu. Gdy podczas manifestacji antyrządowych doszło do zamieszek, al-Asali skierował na ulice wojsko. Niepopularny wśród protestujących, w 1948 wyszedł cało z kilku zamachów na swoje życie.
Po zamachu stanu przeprowadzonym w marcu 1949 przez szefa sztabu armii syryjskiej Husniego az-Za’ima wszystkie działające w Syrii partie zostały zdelegalizowane. Al-Asali odmówił współpracy z nowym rządem i został umieszczony w areszcie domowym. Odzyskał wolność po kolejnym zamachu stanu, który w sierpniu 1949 przeprowadził Sami al-Hinnawi, jednak nie powrócił do życia publicznego. Początkowo prowadził również żadnej aktywności politycznej za autorytarnych rządów Adiba asz-Sziszakliego, następnie jednak zaczął działać w opozycyjnej grupie polityków przebywających w Hims, planujących obalenie rządów wojskowych i przywrócenie demokratycznego porządku.