Badania W wieku 22 lat rozpoczął intensywne badania dotyczące botaniki. Interesowały go głównie rośliny występujące w regionie wschodnich Alp. W celu poznawania nowych gatunków i badania już znanych, Wulfen bardzo często ruszał na badania terenowe. W 1781 roku opublikował Plantae rariorum Carinthicae, obszerne i bogato ilustrowane studium poświęcone florze alpejskiej. Szczególne dużo informacji zgromadził na temat porostów, które uważał za podgatunek glonówWulfen, Franz Xaver Freiherr von w:Allgemeine Deutsche Biographie. Odbył również wiele podróży na tereny położone na południe od Alp, często bywał nad morzem Adriatyckim. Badał także faunę środkowej Austrii i wybrzeża adriatyckiego. Interesowały go głównie owady, ryby i ptaki.
Uznanie W 1782 roku, Nikolaus Joseph von Jacquin nazwał na jego cześć rodzaj roślin mianem WulfeniaTaxonomic literature : a selective guide to botanical publications and collections with dates, commentaries and types. Wulfenit, minerał z grupy molibdenianów, został tak nazwany na cześć Wulfena przez von HaidingeraMindat.orgAEIOU Encyclopedia. W 1838 roku w Klagenfurcie wzniesiono pomnik upamiętniający Franza Xavera.