Po powrocie do Châteaubriant, Françoise nadal mieszkała z mężem, Janem, który został mianowany gubernatorem Bretanii i otrzymał różne inne zaszczytne funkcje. Françoise wciąż jeszcze pisała listy do króla, który odwiedzał Châteaubriant wiele razy i za każdym razem spotykał Françoise, którą traktował z wielkim szacunkiem i która do śmierci zachowała do niego głębokie uczucie. Jego ostatnia wizyta miała miejsce w 1532, kiedy mieszkał w Nowym Zamku.
Françoise de Foix zmarła 16 października w 1537. Jej śmierć jest tematem wielu plotek: jedna z legend, opisanych przez francuskiego historyka Varillasa, który opisał rzekomo ostatnie chwile królewskiej faworyty - znany z brutalności Jan de Laval miał zamknąć swoją żonę na długie lata w ciemnicy i wpaść do jej więzienia po kilku latach i przeciąć jej żyły, wskutek czego umarła z wykrwawienia. W istocie, uważa się, że bardziej prawdopodobne jest wersja, że Françoise zmarła z powodu choroby.