Okres służby dyplomatycznej poświęcił badaniom archeologicznym oraz zgłębianiu kultury Majów, nauczył się m.in. ich języka.
Przez ponad 40 lat pobytu w Meksyku prowadził badania stanowisk związanych z cywilizacją Majów, w tym najważniejsze na stanowisku w Chichén Itzá. W 1894 roku zakupił ziemię na której położone było to starożytne miasto, poświęcając się zakończonym sukcesem wieloletnim poszukiwaniom opisanej przez Diego de Landę świętej cenote. Z dna studni wydobył wiele artefaktów, które przekazał do Peabody Museum. W 1926 roku rząd meksykański oskarżył Thompsona o nielegalny wywóz zabytków i odebrał ziemię, zmuszając go do powrotu do USA. Swoje badania opisał w wydanej w 1932 roku pracy The People of the Serpent.
Zmarł 18 maja 1935 roku w wieku 79 lat w Plainfield w stanie New Jersey.
Przypisy
Kategoria:Amerykańscy archeolodzy Kategoria:Amerykańscy dyplomaci Kategoria:Urodzeni w 1856 Kategoria:Ludzie urodzeni w Worcesterze (Massachusetts) Kategoria:Zmarli w 1935