Rozkazem organizacyjnym dowódcy WOP nr 018 z 27.02.1964, 1 kwietnia 1964 utworzono GPK Jakuszyce (drogowa). Przybyło kilka baraków i placówka Urzędu Celnego. thumb|GPK Jakuszyce (1968) 1 lipca 1965 Wojska Ochrony Pogranicza podporządkowano Ministerstwu Obrony Narodowej, Dowództwo WOP przeformowano na Szefostwo WOP z podległością Głównemu Inspektoratowi Obrony Terytorialnej. Do Ministerstwa Spraw Wewnętrznych odeszła cała kontrola ruchu granicznego oraz ochrona GPK. Tym samym naruszono jednolity system ochrony granicy. GPK Jakuszyce weszła w podporządkowanie Wydziału Kontroli Ruchu Granicznego Komendy Wojewódzkiej Milicji Obywatelskiej, kontrolę graniczną wykonywali funkcjonariusze Milicji Obywatelskiej podlegli MSW.
1 października 1971 WOP został podporządkowany pod względem operacyjnym, a od 1 stycznia 1972 pod względem gospodarczym MSW. Do WOP powrócił cały pion kontroli ruchu granicznego wraz z przejściami. Przywrócono jednolity system ochrony granicy państwa. GPK Jakuszyce podlegało bezpośrednio pod sztab Łużyckiej Brygady WOP w Lubaniu.
W 1974, w porozumieniu z władzami czechosłowackimi, siedziba polskiej GPK, została przeniesiona do nowo wybudowanego przez stronę CSRS obiektu, spełniającego warunki GPK. Wykonawcą było Wrocławskie Przedsiębiorstwo Robót Budowlanych nr 2.