Jako podstawowy piłkarz zajął z nią pierwsze miejsce w wiosennej fazie Primera Etapa sezonu 2016.
W lipcu 2016 Penilla powrócił do Meksyku, udając się na wypożyczenie do drużyny Monarcas Morelia.
Kariera reprezentacyjna W styczniu 2011 Penilla został powołany przez szkoleniowca Sixto Vizuete do reprezentacji Ekwadoru U-20 na Mistrzostwa Ameryki Południowej U-20. Tam nie potrafił sobie jednak wywalczyć miejsca w składzie, rozgrywając trzy z dziewięciu spotkań (z czego zaledwie jedno w wyjściowej jedenastce). Jego kadra z drugiej pozycji zdołała awansować do rundy finałowej, a tam z kolei zakończyła zmagania na czwartej lokacie, dzięki czemu zakwalifikowała się na Mistrzostwa Świata U-20 w Kolumbii. On sam nie znalazł się jednak w składzie na światowy czempionat.
W seniorskiej reprezentacji Ekwadoru Penilla zadebiutował za kadencji tymczasowego selekcjonera Sixto Vizuete, 10 października 2014 w zremisowanym 1:1 meczu towarzyskim z USA. Już cztery dni później strzelił natomiast premierowego gola w kadrze narodowej, w wygranym 5:1 sparingu z Salwadorem.