Jednostki organizacyjne Chorągiew Najmniejszą jednostką organizacyjną zgromadzenia jest Chorągiew, która działa na terenie parafii. Do utworzenia Chorągwi potrzebnych jest sześciu braci oraz zgoda proboszcza danej parafii, który po jej utworzeniu staje się kapelanem wspólnoty. Dowódcą Chorągwi jest Wielki Rycerz, który jest jednym z trzech oficerów (oprócz niego Kanclerz i Skarbnik) wybieranych na roczną kadencję.
Komandoria Komandoria odpowiada terytorialnie diecezji. Komandorię tworzą rycerze wszystkich Chorągwi danej diecezji. Wielcy Rycerze z terenu Komandorii tworzą kapitułę, która wybiera Komandora. Komandor odpowiada za pracę Chorągwi na swoim terenie oraz za współpracę z władzami kościelnymi. Kadencja Komandora trwa 3 lata.
Prowincja Na czele prowincji stoi Prowincjał, którego kadencja wynosi cztery lata.
Generalat To „rada ministrów” Zakonu. Składa się z oficerów generalnych, którzy odpowiadają m.in. za administrację, finanse, formację, aspekty prawne, kontakty zagraniczne, mienie, pomoc bratnią, pro-life, działalność charytatywną, ceremoniał.