Rozwój zarodka pozostaje zawieszony do początku inkubacji. Świeżo złożone jaja kur domowych, strusi i wielu innych gatunków ptaków mogą być przechowywane przez około dwa tygodnie w temperaturze poniżej 5 °C. Dłuższe okresy zawieszenia rozwoju zarodka zaobserwowano u niektórych ptaków morskich. Niektóre gatunki rozpoczynają inkubację w momencie złożenia pierwszego jaja, w efekcie czego młode wykluwają się w różnych odstępach czasu. Inne rozpoczynają po złożeniu drugiego jaja tak, że trzecie pisklę jest mniejsze i bardziej podatne na niedobory żywności. Niektóre zaczynają wysiadywać po złożeniu ostatniego jaja z lęgu, co prowadzi do jednoczesnego wyklucia się piskląt.

Okres inkubacji u ptaków Poniższa tabela przedstawia okres inkubacji jaj u niektórych ptaków: ptak Okres inkubacji (dni) starzyki 10 wróble 11–13 drozdy 13–14 przepiórki 16–23 kura domowa 21 kaczki 21–30 papugi 22–31 bażanty 23–27 płomykówka 30 gęsi 30–35 sokoły 31–33 strusie 50–60 emu 70–80 albatros królewski 80