Spłonął w czasie katastrofalnego w skutkach pożaru Muzeum Botanicznego w Berlinie-Dahlem w czasie bombardowania w 1943 roku.
Na cześć Elsholtza w 1790 roku Carl Ludwig Willdenow jeden z rodzajów z rodziny jasnotowatych nazwał Elsholtzia.
Publikacje
Anthropometria, sive De mutua membrorum corporis humani proportione. Accessit doctrina naevorum […]. Patavii. Typis Jo. Baptistae Pasquati, 1654 (Wydanie Frankfurt (Oder) 1663). Hortus Berolinensis, 1657 (rękopis). Publikacja wydana po raz pierwszy: Thomas Fischbacher, Thomas Fink (red.): Johann Sigismund Elsholtz: Hortus Berolinensis. Der Berliner Lustgarten. Lateinisch / Deutsch. Liber primus. Erstes Buch, Weimar 2010, , także: Felix Mundt, Marcel Humar (red.): Johann Sigismund Elsholtz. Hortus Berolinensis. Erstes Buch, Worms 2010, . Plantae singulares horti electoralis Brandenburgici coloniensis, Cölln an der Spree, 1659/60. Flora marchica, sive catalogus plantarum, quæ partim in hortis Electoralibus Marchiæ Brandenburgicæ primariis, Berolinensi, Aurangiburgico, et Potstamensi excoluntur, partim sua sponte passim proveniunt, Berolini, ex officina Rungiana. Sumptibus Danielis Reichelii, 1663. Historia Steatomatis resecti et feliciter sanati, Coloniae Brand.: Schulze, 1666. Clysmatica Nova, Berlin, 1665;