W 2016 roku wszczęto przeciw niemu procedurę impeachmentu, podobnie jak wobec prezydent Rousseff. W związku z zawieszeniem Rousseff, 12 maja tego samego roku przejął tymczasowo obowiązki prezydenta Brazylii. 31 sierpnia 2016 w wyniku impeachmentu wobec prezydent Dilmy Rousseff, objął urząd prezydenta Brazylii.
Jeszcze w tym samym roku został oskarżony o korupcję, jednak na impeachment oraz postawienie przed sądem dwukrotnie nie zgodził się parlament, którego 1/3 składu objęta jest również śledztwami prokuratorskimi. Pod koniec 2017 roku jego notowania kształtowały się na poziomie od 3 do 6%, co czyniło go najmniej popularnym prezydentem w historii kraju.
Życie prywatne Dwukrotnie żonaty. Z pierwszą żoną, Marią ma troje dzieci, a z drugą, Marcelą, ma jedno dziecko.