Zwirner był wydawcą „Phonometrische Forschungen” (4 tomy, od 1936), „Archiv für vergleichende Phonetik” i „Archiv für Sprach- und Stimmphysiologie” (1937-1947). Poza tym napisał razem z Kurtem Zwirnerem Grundfragen der Phonometrie (1936), 2., rozszerzone i ulepszone wydanie 1966 (jako część I Zwirner & Ezawa 1966-1969).
Eberhard Zwirner jest także inicjatorem korpusu Deutsche Mundarten (Gwary niemieckie), dostępnego dla celów naukowych za pośrednictwem Archiv für gesprochenes Deutsch (Archiwum mówionej niemczyzny).
Artykuły Eberhard Zwirner: Deutsches Spracharchiv 1932-1962. Geschichte, Aufgaben und Gliederung, Bibliographie. Münster 1962. Eberhard Zwirner & Kennosuke Ezawa (Hrsg.): Phonometrie, Erster-Dritter Teil. Karger, Basel/ New York 1966, 1968, 1969. Eberhard Zwirner & Kurt Zwirner: Lauthäufigkeit und Zufallsgesetz. In: Forschungen und Fortschritte 11, Nr. 4, 1935, 43-45. (Auch in: Zwirner & Ezawa (Hrsg.), Dritter Teil: 55-59.) Eberhard Zwirner & Kurt Zwirner: Grundfragen der Phonometrie. Metten, Berlin 1936. (2. Auflage als Zwirner & Ezawa (Hrsg.) Teil I, 1966) Eberhard Zwirner & Kurt Zwirner: Lauthäufigkeit und Sprachvergleichung. In: Monatsschrift für höhere Schulen 37, 1938, 246-253.