Nazwa Drużyna Mistrz Polski Legia Warszawa Wicemistrz Polski Lech Poznań Zdobywca Pucharu Polski Legia Warszawa Zdobywca Superpucharu Polski Ekstraklasa SA podjęła decyzję o tym, że nie będzie meczu o Superpuchar Polski Spadek z Ekstraklasy GKS Bełchatów, Polonia WarszawaPolonia Warszawa została zdegradowana w związku z nieotrzymaniem licencji na grę w Ekstraklasie w sezonie 2013/2014, przez co w Ekstraklasie utrzymał się Ruch Chorzów Mistrz w I lidze Zawisza Bydgoszcz Awans do Ekstraklasy Zawisza Bydgoszcz, Cracovia Spadek z I ligi Okocimski KS Brzesko, Warta Poznań, Polonia Bytom, ŁKS ŁódźŁKS Łódź wycofał się z rozgrywek po 22. kolejce. Mistrz w II lidze zachodniej Energetyk ROW Rybnik Awans do I ligi Energetyk ROW Rybnik, Chojniczanka Chojnice Spadek z II ligi zachodniej MKS Oława, Elana Toruń, Tur TurekElana Toruń i Tur Turek nie otrzymały licencji uprawniającej do gry w II lidze w sezonie 2013/2014, w związku z tym utrzymał się Ruch Zdzieszowice. Zgodnie z Uchwałą nr VI/96 Zarządu PZPN z 19 kwietnia 2011 drużyny z Torunia i Turku zostały przesunięte na ostatnie miejsce w tabeli, Lech RypinLech Rypin wycofał się z rozgrywek po rundzie jesiennej.