Pierwszą bramkę dla Chelsea strzelił w 1/16 finału Pucharu Ligi w wygranym 2–1 meczu z Evertonem, a jego pierwszą bramkę ligową zdobył jedynego gola w domowym zwycięstwie nad Swansea City 29 listopada 2017 roku.
22 grudnia 2019 roku Rüdiger złożył skargę na rasistowski atak podczas meczu wyjazdowego przeciwko Tottenhamowi Hotspur, który spotkał się z szerokim rozgłosem medialnym. Wywołało to wezwanie do działań rządowych w sprawie rasizmu w piłce nożnej. Jednak po dochodzeniu policji nie znaleziono dowodów na rasistowskie nadużycia wobec Rüdigera, a policja ostatecznie umorzyła sprawęInvestigation finds ‘no evidence’ of alleged racism against Chelsea’s Rüdiger – The Guardian..
1 lutego 2020 roku w swoim 100. występie w klubie strzelił obie bramki dla Chelsea, obie główkami, z asystami od Masona Mounta w remisie 2–2 z Leicester City na King Power Stadium.
29 maja 2021 roku wygrał swój pierwszy w historii Ligę Mistrzów UEFA po tym, jak Chelsea pokonała Manchester City 1–0 w finale na Estádio do Dragão.
12 kwietnia 2022 roku strzelił swoją pierwszą bramkę w Lidze Mistrzów w wygranym 3–2 wyjazdowym meczu z Realem Madryt w ćwierćfinale sezonu 2021–22;