Działania, które podejmował miały pokojowymi metodami doprowadzić do uchylenia wprowadzonych ustaw.
Aresztowany został gdy z żoną i dziećmi udawał się do prywatnego domu, gdzie miała być odprawiona msza. Został rozstrzelany tego samego dnia, a wraz z nim zginęli w dzień święta Wniebowzięcia Najświętszej Maryi Panny ksiądz Ludwik Batiz Sáinz i wierni świeccy: Salwator Lara Puente i Dawid Roldán Lara.
Relikwie Emanuela Moralesa zostały przeniesione do kościoła „San Pedro” w Chalchihuites, które jest miejscem szczególnego kultu świętego i spoczywają obok relikwii świętych Ludwika Batiz Sáinz, Salwatora Lara Puente i Dawida Roldán Lara.
Atrybutem świętego męczennika jest palma.
Śmierć Emanuela Moralesa była wynikiem nienawiści do wiary odium fidei. Po zakończeniu procesu informacyjnego na etapie lokalnej diecezji, który toczył się w latach 1933–1988 w odniesieniu do męczenników okresu prześladowań Kościoła katolickiego w Meksyku, został beatyfikowany 22 listopada 1992 roku w watykańskiej bazylice św. Piotra, a jego kanonizacja na Placu Świętego Piotra, w grupie Krzysztofa Magallanesa Jary i 24 towarzyszy, odbyła się 21 maja 2000 roku.