W latach 1996–1999 zastępczyni dyrektora do spraw Badań Naukowych w Instytucie Filologii Angielskiej UAM. Od 1997 roku kierowniczka Zakładu Języka Angielskiego w IFA. Dwukrotnie pełniła stanowisko pierwszej zastępczyni dyrektora w Instytucie Filologii Angielskiej podczas kadencji 1999–2002 oraz 2002–2005. Założycielka i kierowniczka Interdyscyplinarnego Centrum Przetwarzania Mowy i Języka (CSLP) na Uniwersytecie im. Adama Mickiewicza. W latach 2005–2012 dyrektorka Instytutu Filologii Angielskiej UAM.
Od 2005 roku członkini podkomitetu Teorii Języka Komitetu Językoznawstwa Polskiej Akademii Nauk. Członek Komitetu Językoznawstwa PAN podczas kadencji 2007–2010. 24 stycznia 2011 prof. Barbara Kudrycka, Minister Nauki i Szkolnictwa Wyższego powołała prof. Katarzynę Dziubalską-Kołaczyk w skład Zespołu Doradczego Rady Narodowego Programu Rozwoju Humanistyki. W 2012 została wybrana na stanowisko dziekana nowo utworzonego Wydziału Anglistyki Uniwersytetu im. Adama Mickiewicza w Poznaniu na kadencję 2012–2016, a w 2016 została ponownie wybrana na kadencję 2016–2020.