W maju 1987, na krótko przed wyborami, przeżył wypadek lotniczy w Lubece.
Afera Barschela Afera Barschela (niem. Barschel-Affäre) była jedną z największych afer politycznych w powojennych Niemczech. Rzecznik prasowy Uwego Barschela, Reiner Pfeiffer, powiedział na łamach Der Spiegel, że za namową Barschela szpiegował Björna Engholma, kandydata Socjaldemokratycznej Partii Niemiec na premiera w najbliższych wyborach lokalnych, w celu doprowadzenia do anonimowego oskarżenia Engholma z powodu podejrzeń o oszustwa podatkowe. Pfeiffer dodał, że wydał rozkaz założenia podsłuchu w telefonie Barschela i oskarżył SPD, że byli sprawcami tego czynu.
W konsekwencji CDU straciła głosy w wyborach, natomiast SPD stała się najsilniejszą partią w Szlezwiku-Holsztynie. Jednak CDU podjęła rozmowy koalicyjne z Wolną Partią Demokratyczną (FPD). 18 września 1987, 5 dni po wyborach, Barschel zaprzeczył wszelkim zarzutom i oświadczył:
Barschel ustąpił ze stanowiska premiera 2 października. Pierwsza komisja śledcza z 1987 roku nie przyniosła żadnych rezultatów, druga, z 1995, doszła do wniosku, że wina Barschela mogła być bezpodstawna.