Swój debiut w klubie zaliczył w wygranym 2:1 meczu wyjazdowym ze VfB Stuttgart.
W 2020 roku Lindner przeszedł do szwajcarskiego klubu FC Basel. Swój debiut zaliczył w przegranym 2:1 meczu z BSC Young Boys.
W 2022 roku Lindner przeszedł do szwajcarskiego klubu FC Sion. Swój debiut zaliczył w wygranym 3:2 meczu z FC Lugano.
Sezon Klub Kraj Rozgrywki Mecze Bramki 2007/08 Austria Wiedeń II
Erste Liga 1 0 2008/09 Austria Wiedeń II
Erste Liga 10 0 2009/10 Austria Wiedeń
Bundesliga 16 0 2009/10 Austria Wiedeń II
Erste Liga 13 0 2010/11 Austria Wiedeń
Bundesliga 24 0 2011/12 Austria Wiedeń
Bundesliga 23 0 2012/13 Austria Wiedeń
Bundesliga 36 0 2013/14 Austria Wiedeń
Bundesliga 36 0 2014/15 Austria Wiedeń
Bundesliga 31 0 2015/16 Eintracht Frankfurt
Bundesliga 0 0 2016/17 Eintracht Frankfurt
Bundesliga 2 0 2017/18 Grasshopper Club Zurych
Super League 36 0 2018/19 Grasshopper Club Zurych
Super League 35 0 2019/20 SV Wehen Wiesbaden
2.