Pracownicy oraz studenci mają możliwość korzystania z biblioteki uniwersyteckiej, będącą jedną z największych tego typu placówek w obwodzie nowosybirskim. Z zasobów biblioteki korzystać można w 4 czytelniach, posiadającymi 359 miejsc. Przy uniwersytecie działa także muzeum, wystawiające zbiory związane m.in. z historią i archeologią regionu, a także z historią edukacji na tych ziemiach.
Struktura Nowosybirski Pedagogiczny Uniwersytet Państwowy ma skomplikowaną strukturę. Dzieli się dziewięć instytutów, pięć wydziałów (fakultetów) i trzy ogólnouniwersyteckie katedry. Oprócz tego przy uczelni działa jeszcze osiem różnych centrów uniwersyteckich. Instytut Nauk o Dzieciach Instytut Nauk Przyrodniczych i Socjoekonomicznych Instytut Sztuk Instytut Historii, Nauk Humanistycznych i Edukacji Społecznej Instytut Polityki Młodzieżowej i Pracy Socjalnej Instytut Otwartej i Zdalnej Edukacji Instytut Reklamy Instytut Filologii, Środków Masowego Przekazu i Psychologii Instytut Fizyko-Matematyczny i Edukacji Informatyczno-Ekonomicznej Wydział Języków Obcych Wydział Kultury i Dalszej Edukacji Wydział