Działalność Stowarzyszenie prowadzi szereg różnego rodzaju działań związanych ze swoimi celami statutowymi. Są to m.in.: Internetowa Lista Ateistów i Agnostyków – kampania społeczna polegająca na dobrowolnej deklaracji publicznej, że jest się ateistą bądź religijnym agnostykiem, mająca na celu promocję społeczną oraz afirmację osób niewierzących, obalanie stereotypów na temat osób niewierzących oraz integrację polskiego środowiska ateistycznego agnostycznego. Propagowanie ceremonii humanistycznych – według terminologii stosowanej przez Stowarzyszenie jest to zespół świeckich ceremonii obejmujących wszystkie przełomowe momenty w życiu człowieka, które ten chciałby szczególnie uhonorować: ceremonia nadania imienia (powitania w rodzinie), ceremonia rozkwitu, ślub humanistyczny, pogrzeb humanistyczny. W ramach propagowania tej idei Stowarzyszenie prowadzi m.in. dedykowaną stronę internetową na ten temat. Etyka w szkole – projekt Warszawskiego Oddziału Stowarzyszenia, którego celem jest wspieranie nauczycieli, młodzieży i rodziców w zakresie przedmiotów szkolnych z grupy „Edukacja Obywatelska”, a szczególnie pomoc w wypracowaniu materiałów pomocniczych do nauki etyki. W ramach projektu jest m.in.