Sezon 2023/2024 Z powodu choroby Robert Dymkowski zrezygnował z trenowania kobiecej Pogoni. W lipcu 2023 nowym prezesem kobiecej Pogoni został Artur Dmowski, który zastąpił na tej funkcji Macieja Burytę. 18 lipca 2023 w funkcji trenera zastąpił go Piotr Łęczyński. Pierwszy ligowy mecz drużyna rozegrała 19 sierpnia wygrywając z AZS UJ Kraków 2:1. 16 marca 2024 Pogoń po raz pierwszy rozegrała mecz na obiekcie im. Floriana Krygiera przy ul. Twardowskiego grając przeciwko Śląskowi Wrocław. W sezonie 2023/2024 drużyna wywalczyła tytuł mistrzyń Polski wygrywając w finale z GKS Katowice. W czerwcu 2024 piłkarki Pogoni: Martyna Brodzik, Natalia Oleszkiewicz i Natalia Radkiewicz zostały powołane na zgrupowanie reprezentacji Polski. W lipcu tego samego roku Emilia Zdunek i Martyna Brodzik znalazły się w ostatecznej kadrze kobiecej reprezentacji Polski na mecze eliminacyjne do Mistrzostw Europy w 2025.