Zasady są najczęściej identyczne, jak w zawodach wyższej rangi. Równocześnie, w różnych miejscach świata, może się jednak odbywać kilka konkursów Pucharu FIS. Aby wyniki zawodów były zaliczane do klasyfikacji generalnej, muszą w nich wystartować zawodnicy z co najmniej pięciu państw (w odróżnieniu od Pucharu Świata oraz Letniego Grand Prix).
Pierwsze w historii zawody Pucharu FIS odbyły się 17 września 2005 we włoskim Predazzo, na skoczni K-95. Ich tryumfatorem został Austriak Mario Innauer, późniejszy zwycięzca klasyfikacji końcowej.
Koordynatorzy Pucharu FIS Ueli Forrer (2012–2020) Christian Kathol (2020–2022) Hubert Mathis (od 2022)
Edycje EdycjaSezon 1. miejsce 2. miejsce 3. miejsce1.2005/2006 Mario Innauer Wojciech Skupień Gregor Schlierenzauer2.2006/2007 Nicolas Fettner Stefan Innerwinkler Pawieł Karielin3.2007/2008 Markus Eggenhofer Nicolas Fettner Łukasz Rutkowski4.2008/2009 Felix Brodauf David Winkler Marc Krauspenhaar5.2009/2010 Felix Brodauf Nico Hermann Jörg Ritzerfeld6.2010/2011 Tomáš Zmoray Lukas Müller Ilmir Chazietdinow7.2011/2012 Cene Prevc Rok Justin Michael Dreher8.2012/2013 David Unterberger Markus Eisenbichler Markus Schiffner9.2013/2014 Marco Grigoli Pascal Egloff Tomáš Zmoray10.2014/2015 Andrzej Stękała Žiga Mandl Przemysław Kantyka11.2015/2016 Danny Queck Michael Dreher Simon