Gdy tajfun odcina wyspę od świata, dochodzi do serii rytualnych morderstw powiązanych z epitafium, które wydają się niemożliwe do popełnienia przez człowieka.

Rozgrywka Umineko no naku koro ni podobnie jak jej poprzedniczka – Higurashi no naku koro ni – jest przedstawicielem podgatunku sound novel – typu powieści wizualnej kładącej szczególny nacisk na budowanie atmosfery poprzez sferę dźwiękową i muzykę. Wszystkie części gry, tzw. epizody, są liniowe, co oznacza, że gracz nie ma wpływu na rozwój wydarzeń, a każda z części ma tylko jedno zakończenie. Ostatni epizod – Twilight of the Golden Witch – posiada element interaktywności w postaci mini gier, lecz nie zmienia to przebiegu fabuły.

Gracz jest zachęcany do tworzenia teorii na temat wydarzenia zaistniałego podczas spotkania rodziny Ushiromiya w Rokkenjimie oraz do odkrywania, kto jest sprawcą masakry. Pod koniec każdego epizodu odblokowują się Tips – specjalna opcja, w której zawarte są wszystkie dotąd zebrane wskazówki wraz z dwoma epilogami. Po przejściu wszystkich epizodów odblokowuje się opcja wysłuchania utworów występujących w trakcie gry.