Przeważnie przyjmuje się, że większość amonitowatych aktywnie, choć niezbyt szybko pływała, nieliczne rodzaje o bardzo wysmukłej muszli posądzane są o zdolność do szybkiego ruchu, natomiast heteromorfy uważane są za zwierzęta planktoniczne żyjące przy dnie.
Zdecydowana większość amonitów wyginęła w czasie wielkiego wymierania na granicy kreda/paleogen w wyniku katastrofalnych zmian środowiska wywołanych przypuszczalnie upadkiem meteorytu. Kilka gatunków żyjących w Europie na początku danu opisano w 2005 roku, były to jednak prawdopodobnie lokalne populacje, które tylko chwilowo zdołały przetrwać katastrofę kredową.
thumb|300px|Przekrój amonita Z 9 rzędów amonitowatych, najważniejsze są następujące rzędy: Goniatitida (goniatyty, dewon-perm) Clymeniida (klymenie, dewon późny: fran, famen) Ceratitida (ceratyty, perm-trias) Lytoceratida (lytocerasy), jura – kreda Phylloceratida (fyllocerasy), trias – kreda Ammonitida (amonity właściwe, jura, kreda) Ancyloceratida (ankyloceratidy), kreda Systematyka amonitowatych jest jeszcze w ciągłej dyskusji naukowej.