Aivar Anniste (ur. 18 lutego 1980 w Põltsamie) – piłkarz estoński grający na pozycji środkowego pomocnika. Od 2011 roku jest wolnym zawodnikiem.
Kariera klubowa Karierę piłkarską Anniste rozpoczął w klubie Lelle SK. W 1997 roku awansował do kadry pierwszego zespołu i w sezonie 1997/1998 zadebiutował w jego barwach w pierwszej lidze estońskiej. W 1999 roku odszedł z Lelle SK do Flory Tallinn. W 2001 i 2002 roku wywalczył z Florą mistrzostwo kraju. W 2001 roku był wypożyczony do Valgi Warrior, do której trafił potem na zasadzie transferu w 2002 roku. W Valdze grał do końca 2003 roku, a na początku 2004 przeszedł do Viljandi Tulevik.
Od połowy 2004 roku Anniste grał w Norwegii. Do końca roku był zawodnikiem grającego w 2. divisjon (poziom III ligi) Ullensaker/Kisa IL. W 2005 roku wrócił do Estonii i przez cały rok grał w klubie Tammeka Tartu. W 2006 roku znów grał w Norwegii, tym razem w Hønefoss BK. Z kolei w pierwszej połowie 2007 roku występował w szwedzkim Enköpings SK.
Latem 2007 Anniste został zawodnikiem TVMK Tallinn. W 2009 roku odszedł z niego do Flory Tallinn. W 2009 roku zdobył z nią Puchar Estonii, a w 2010 roku wywalczył mistrzostwo kraju.