Latem 2008 Venegas został ściągnięty przez szkoleniowca José Guadalupe Cruza do pierwszoligowego Atlante FC z siedzibą w Cancún. W meksykańskiej Primera División zadebiutował 3 sierpnia 2008 w zremisowanym 0:0 spotkaniu z Morelią i szybko został zawodnikiem wyjściowego składu. W 2009 roku triumfował ze swoją drużyną w najbardziej prestiżowych rozgrywkach północnoamerykańskiego kontynentu – Lidze Mistrzów CONCACAF, jednak bezpośrednio po tym z powodu kontuzji na kilka miesięcy stracił miejsce w pierwszym zespole i wskutek tego nie znalazł się w składzie na Klubowe Mistrzostwa Świata. Niebawem powrócił do pierwszej jedenastki i premierowego gola w najwyższej klasie rozgrywkowej strzelił 3 sierpnia 2011 w wygranym 5:1 spotkaniu z Pueblą. W wiosennym sezonie Clausura 2013 dotarł z Atlante do finału krajowego pucharu – Copa MX, natomiast na koniec rozgrywek 2013/2014 spadł ze swoją drużyną do drugiej ligi meksykańskiej.
W lipcu 2014 Venegas podpisał umowę z zespołem Club Atlas z siedzibą w Guadalajarze, gdzie spędził rok, tworząc podstawową parę stoperów z Enrique Pérezem, jednak nie zdołał osiągnąć większych sukcesów.