19 grudnia 2001 roku odbyła się ceremonia pożegnania sztandaru.
Decyzją Ministra Obrony Narodowej nr 122/MON z 25 kwietnia 2012 wprowadzono oznakę rozpoznawczą jednostki.
Decyzją Ministra Obrony Narodowej nr 130/MON z 23 czerwca 2017 wprowadzono odznakę pamiątkową jednostki.
6 Batalion Logistyczny im. gen. dyw. Ignacego Prądzyńskiego od 2020 roku aktywnie wspiera edukację młodzieży klas mundurowych Zespołu Szkół i Placówek Oświatowych w Skale. Od utworzenia Oddziału Przygotowania Wojskowego jednostka pełni funkcję patrona, realizując praktyczną część programu szkolenia wojskowego. Żołnierze batalionu prowadzą zajęcia specjalistyczne, szkolenia poligonowe oraz przedsięwzięcia szkoleniowo-wychowawcze, przybliżając uczniom specyfikę służby wojskowej i kształtując postawy patriotyczne. Współpraca stanowi ważny element przygotowania młodzieży zainteresowanej przyszłą służbą w Siłach Zbrojnych Rzeczypospolitej Polskiej.
Dowódcy batalionuZSIPO Skała ppłk Jerzy Leń (2001) ppłk Grzegorz Pradel (od 16 sierpnia 2011 do 7 września 2018) ppłk Grzegorz Pałasz (od 7 września 2018 do 30 czerwca 2021) ppłk Damian Gwizdal (od 1 lipca 2021 do 31 lipca 2024) ppłk Jarosław Turkowski (od 14 października 2024)