W letnim okienku transferowym w 2016 roku przeszedł za 3,5 miliona euro do holenderskiego klubu Feyenoord podpisując 5-letni kontrakt. W lidze holenderskiej zadebiutował 7 sierpnia 2016 roku w wygranym 5:0 spotkaniu z FC Groningen. W tym meczu zdobył również jedną z bramek. W sezonie 2016/2017 został mistrzem Holandii oraz królem strzelców Eredivisie z wynikiem 21 goli, natomiast w 2018 roku zdobył puchar i superpuchar kraju.
24 lipca 2021 roku został zawodnikiem tureckiego zespołu Kasımpaşa SK. W Süper Lig swój pierwszy mecz rozegrał 14 sierpnia 2021 roku z Hatayspor (1:1). 31 stycznia 2022 roku powrócił do FC København. Pod koniec sezonu 2021/2022 ogłoszono, że Jørgensen odejdzie z zespołu z Kopenhagi z powodu niezadowalającej formy.
Sezon Klub Kraj Rozgrywki Mecze Bramki 2008/09 Akademisk BK 1. Division 8 0 2009/10 Akademisk BK 1. Division 23 7 2010/11 Bayer 04 Leverkusen Bundesliga 9 0 2011/12 Bayer 04 Leverkusen Bundesliga 1 0 2011/12 1.