Misja i cele Ruch Europejski Niemcy jest organizacją instytucjonalnie wspieraną przez Ministerstwo Spraw Zagranicznych i Budżet Federalny i dlatego nie jest organizacją pozarządową. Z prawnego punktu widzenia i z uwagi na charakter stosunków instytucjonalnych z Ministerstwem Spraw Zagranicznych zbliżony jest do Instytutu Goethego i choć nie posiada umowy ramowej z MSZ, prowadzi ścisłą współpracę merytoryczną i organizacyjną z departamentem ds. europejskich. W ramach koncepcji „Europa-Kommunikation & Europäische Vorausschau” (komunikacja i perspektywa europejska) uzgadnianej wspólnie z Departamentem ds. europejskich, RE Niemcy oferuje organizacjom członkowskim spotkania informacyjne dotyczące aktualnych konsultacji Komisji Europejskiej oraz postanowień Rady Unii Europejskiej.
RE Niemcy prowadzi postępowania rekrutacyjne wśród niemieckich studentów do Kolegium Europejskiego w Brugii i Natolinie. Biuro Ruchu Europejskiego w Bonn organizuje z kolei tzw. Konkurs Europejski, w którym corocznie bierze udział ok. 70 tys.