Przemysłowej oraz sprawowała nadzór nad izbą chorych i pracą lekarzy. W lipcu 1944 roku została zwolniona z pracy.

Sydonia Bayer została aresztowana 14 marca 1945 roku i osadzona w miejscu dawnej swojej pracy – w więzieniu przy ul. Gdańskiej 13 w Łodzi. Jej proces toczył się przed Specjalnym Sądem Karnym w Warszawie z siedzibą w Łodzi 6 września 1945 roku. Bayer została oskarżona o udział, jako kierowniczka obozu karnego przy ul. Przemysłowej, w znęcaniu się nad polskimi dziećmi, oraz (obok funkcyjnej Genowefy Pohl) w szczególności przyczynienie się do śmierci Urszuli Kaczmarek i Teresy Jakubowskiej. Za zbrodnie, wyrokiem sądu, skazana została w dniu procesu na karę śmierci. Prezydent nie skorzystał z prawa łaski i tym samym wyrok wykonano 12 listopada 1945 roku na terenie więzienia przy ul. S. Sterlinga 16.

Zbrodnie Podczas pełnienia swojej służby stała się sławna ze swego okrucieństwa wobec więźniów. Otrzymała przydomek „Frau Doktor” z racji pełnienia w obozie nadzoru lekarskiego, który przybierał w jej wykonaniu formę sadystycznych tortur. Była najokrutniejszą „wychowawczynią” w obozie. „Lubowała się w wywlekaniu chorych dzieci na śnieg i polewaniu ich zimną wodą.(…) Kazała je chłostać, bić, kopać, pozbawiała posiłków”.