Fryderyk II nie podzielił w pełni poglądu Brenckenhoffa i w 1774 r. utworzono tymczasowo Komisję Kameralną z siedzibą w Bydgoszczy. Jej dyrektorem mianowany został von Gaudi. Brenckenhoffowi powierzono jednak ogólny nadzór administracyjny. Pełnił rolę królewskiego zarządcy, pośrednika w kontaktach z monarchą. Był odpowiedzialny za ogólny rozwój dystryktu i jego zagospodarowanie dla dobra Królestwa Prus. Powierzona mu funkcja nie miała precedensu w nomenklaturze administracji pruskiej. Było to prowizoryczne stanowisko jako wyraz uznania dla jego zasług.
Organizator budowy Kanału Bydgoskiego We wrześniu 1772 r. Fryderyk II powierzył mu ogólny nadzór administracyjny i organizację prac związanych z budową Kanału Bydgoskiego. Pierwsze prace ziemne rozpoczęto na wiosnę 1773 r. Do budowy kanału Brenkenhoff zaangażował robotników przybyłych z głębi Niemiec i Czech. Już w trakcie budowy kanału powstawały, usytuowane opodal placów budowy, kolonie osadnicze.